2003年1月，成立美兰区教育科技局，前身为振东区教育科技局，同时设立美兰区信息管理办公室和区科学技术协会。区教育科技局的公务员核定编制12人，事业编制18人；区信息管理办公室核定事业编制3人；区科学技术协会公务员核定编制3人。

    2008年8月，美兰区科技部门从教育科技部门中分离出来，成立科技和信息产业局。2010年，更名为区科学技术工业信息化局(同时挂知识产权局、地震局牌子)。区科学技术工业信息化局为正科级单位，有行政编制6名，其中正职领导1名，副职领导2名。区信息中心自2009年由区政府办公室划归区科学技术工业信息化局管理，为副科级事业单位，编制数3名，领导1名。4个镇、9个街道办事处配备了分管科技工作的副镇长(副主任)，53个村委会、52个居委会也配备科技副主任。各镇、街道办事处先后成立了科学技术协会，4个镇还成立科技110服务站。

    至2010年，全区各大中型企业基本都成立了科研机构，中小企业8O%成立了技术科或研究室，具备了一定的研发能力。当年辖区拥有独立科研与技术开发机构15个，其中省级重点实验室7个，省级工程技术研究中心8个(其中，海南大学拥有海南省重点实验室6个、海南省工程技术研究中心2个)，各类专业技术人员19700人，经营管理人才243人，农村实用人才385人。主要科研机构有海南大学、海南省水产研究所、海南立昇净水科技实业有限公司、海南省气象科学研究所、海南皇隆制药厂有限公司和海南金鹿农机发展股份有限公司。其中，海南省水产研究所是海南省唯一直属于省海洋与渔业厅的水产科研机构，拥有科技人员40余人，承担了一大批国家级和省级水产科研项目，部分技术处于国内领先水平或先进水平，成为海南省渔业科技创新体系的重要组成部分。海南立昇净水科技实业有限公司是国家重点扶持的高新技术企业，先后承担国家火炬计划、国家“十五”科技攻关计划项目，参与和承担国家863计划、国家“十一五”重大科技专项(水专项)等科研攻关任务，并获得丰硕科研成果。

    2005～2010年，美兰区连续3次获得“全国科技进步先进区”荣誉。